Eléments mobiles, intégrité et plasticité du génome humain

(Département Dynamique du Génome)

 

Responsable -équipe émergente- : Nicolas GILBERT

 

La majorité des génomes eucaryotes sont constitués en grande partie de séquences répétées dispersées. Le rétrotransposon LINE-1 (ou L1, pour Long Interspersed Element-1) en est le représentant majoritaire dans les génomes mammifères. En effet il représente près de 17 % de la masse génomique chez l'homme. La vaste majorité des séquences L1 présentes dans notre génome sont considérées comme fossiles moléculaires. Cependant, il existe environ 100 copies de L1 actives (RC-L1). Du fait de leurs mobilités, les RC-L1 sont des agents de mutation insertionnelle. De plus, du fait de son grand nombre de copies, L1 peut générer des réarrangements génomiques délétères, induit par recombinaison homologue non allélique.

Bien que les RC-L1 induisent des instabilités génétiques, l'ensemble des étapes du mécanisme de mobilité de ces derniers, appelé rétrotransposition, reste encore méconnu. Grâce à l'utilisation de nouveaux outils de biologie moléculaire et cellulaire, nos travaux visent à élucider les différentes étapes de la rétrotransposition. Nous nous intéressons en particulier à la formation d'un complexe ribonucleoproteique (RNP), intermédiaire de la rétrotransposition. Nous cherchons aussi à comprendre les interactions qui existent entre le mécanisme de rétrotransposition et les mécanismes de réparation de l'ADN, nécessaires pour la résolution de l'insertion d'une nouvelle copie de L1 dans le génome. Par une approche complémentaire, nous utilisons des outils bioinformatiques pour analyser l'implication de L1 dans l'évolution et la variabilité génétique des génomes mammifères.

 

 

 

Les publications de l'année (2013) de l'équipe :

Schmith A, Groth M, Ratka J, Gatz S, Spaller T, Siol O, Glöckner G, Winckler T.. Conserved gene-regulatory function of the carboxy-terminal domain of dictyostelid C-module-binding factor (2013), Eukaryot Cell. : 12, 3, 460-468

[Medline - Abstract]

 

Toutes les publications de l'équipe

Personnel de l'équipe :

Nom / prénom	Localisation	Poste	Situation
Chercheur
GILBERT Nicolas	128-129	9947	CR (INSERM) + HDR
Post-Doc
SIOL Oliver	128-129	9947	(CNRS)
CDD
BARTHE Antoine	128-129	9947	IE (CNRS)