RNA silencing et Contrôle de la Transposition

(Département Dynamique du Génome)

 

Responsable : Severine CHAMBEYRON

 

Notre projet a pour but d'élucider les mécanismes de contrôle des éléments transposables (ET), fondamentaux pour le maintien de l'intégrité des génomes. Ils font intervenir une classe de petits ARN, les piRNA (« Piwi-interacting RNA »). La voie de silencing associée aux piRNA est très largement inconnue, et le présent projet propose d'en caractériser les étapes essentielles dans l'ovaire de drosophile.
Les piRNA sont des éléments clés d'une sorte de système immunitaire à deux composantes: une composante génétique codée par des loci hétérochromatiques contenant des copies défectives d'ET (''piRNA clusters'') produisant des piRNA antisens, et une composante adaptative correspondant aux piRNA produits par les copies fonctionnelles des ET localisées dans l'euchromatine, selon le modèle suivant: des piRNA antisens primaires, produits par un mécanisme inconnu à partir des piRNA clusters, ciblent les transcrits des ET fonctionnels qui sont clivés pour produire les piRNA sens; ces derniers guident le complexe de silencing vers les transcrits des piRNA clusters qui sont clivés pour produire des piRNA antisens secondaires.
Nos résultats montrent l'existence très vraisemblable de cette boucle d'amplification dans la lignée germinale femelle, et que cette amplification n'existe pas dans les cellules somatiques de l'ovaire où seuls les piRNA primaires sont présents.
En se basant sur nos connaissances portant sur le contrôle de deux ET, l'élément I dans le germen et gypsy dans le soma, nous éluciderons la biogenèse des piRNA primaires, le mode d'action des piRNA dans la répression des ET, et les mécanismes épigénétiques de transmission héréditaire de ce mode de silencing.
Nous voulons combiner des approches génétiques afin de comprendre la biogenèse des piRNA primaires avec des nouvelles technologies comme le séquençage à haut débit et des puces afin de donner une vue d'ensemble des mécanismes impliqués dans la voie de régulation par les piRNA.

 

 

Actualités de l'équipe

RNAi and heterochromatin Cells, especially germinal stem cells, maintain genomic integrity by averting the propagation of mutations, generated as a consequence of DNA damage. In particular, they must avoid the deleterious effects of autonomously replicating endogenous transposable elements (TEs), which are known to cause insertional mutagenesis. One of the key players of the TE repression is the piRNA-interacting silencing complex (piRISC), consisting of the association of a PIWI-type Argonaute protein with a small single-stranded PIWI-interacting RNA (piRNA). The applicant will join a group led by Séverine Chambeyron on a project aimed at getting a better understanding of PIWI-piRISC functions in Drosophila ovaries. Indeed, the laboratory has recently started an ambitious project focused on the piRNA-dependent heterochromatin formation on TE sequences in Drosophila. The successful candidate will contribute to this project by developing biochemical approaches to identify specific factors associated with Piwi-piRNA complex on TE sequences. Expertise in epigenetic and/or non-coding RNA fields is recommended. Skills in bioinformatics will be appreciated. Applicants who have defended their PhD for less than 2 years and are first-authors on papers published or accepted by peer-reviewed international journals will be considered with priority. The position can start in July 2013. To apply, please submit an electronic application, which should include a cover letter, your CV, and contact information for 2 references by email to: severine.chambeyron@igh.cnrs.fr. Closing Date: 30 September 2013. Vient de paraitre L'équipe "RNA silencing et Contrôle de la Transposition" de S. CHAMBEYRON vient de mettre en évidence que la transmission d'un caractère acquis pouvait se faire via des petits ARN non codants. Les descendantes de femelles âgées sont davantage capables de maintenir l'intégrité de leur génome que les descendantes de jeunes femelles. Elles transmettent ce caractère à leurs filles (ceci sur plusieurs générations) via des petits ARN non codants, les piRNA. Ces travaux, publiés dans la revue Genome Research du 1er Octobre 2012 (Grentzinger et al.)Grentzinger et al.), ouvrent de nouvelles perspectives dans le domaine de l'épigénétique car ils montrent que les marques épigénétiques ne sont pas uniquement portées par la chromatine. La couverture de ce numéro a été réalisée par Claudia Armenise En savoir plus

 

Les publications de l'année (2013) de l'équipe :

Akkouche A, Grentzinger T, Fablet M, Armenise C, Burlet N, Braman V, Chambeyron S. §, Vieira C§ (co-dernier auteur). Maternally deposited germline piRNAs silence the tirant retrotransposon in somatic cells (2013), EMBO reports : 14, 5, 458-464. doi: 10.1038/embor.2013.38

[Medline - Abstract]

 

Toutes les publications de l'équipe

Personnel de l'équipe :

Nom / prénom	Localisation	Poste	Situation
Chercheur
CHAMBEYRON Severine	S14	9949	CR (CNRS) + HDR
PELISSON Alain	S14	9948	DR (CNRS) + HDR
ITA
BRUN Christine	S14	9949	AI (CNRS)
MUGAT Bruno	S14	9949	IR (CNRS)
Post-Doc
AKKOUCHE Abdou	S14	9949	(CNRS)
Doctorant
GRENTZINGER Thomas	S14	9949	(UM2)