Programmes informatiques et jeux de données

Seitz (2024) Nucleic Acids Research 52(16):9360–9368 :

Scripts et données pour la préparation des figures.

Busseau et al. (2023) Biochimie S0300-9084(23)00145-1 :

Scripts et données pour la préparation des figures et figures supplémentaires - 56 Ko

Houbron et al. (2023) RNA Biology 20(1):272–280 :

Scripts et données pour la préparation des figures et figures supplémentaires - 7,2 Go

Mockly et al. (2022) Nucleic Acids Research 50(8):4703–4712 :

Scripts et données pour la préparation des figures, figures supplémentaires et tableaux supplémentaires - 636Mo

Brechin et al. (2021) RNA 27(2):151-162 :

Scripts et données intermédiaires

Hebras et al. (2020) eLife 9:e60862 :

Scripts et données intermédiaires

Richard et al. (2020) Autophagy 17(8):1889–1906 :

Scripts et données intermédiaires

Pinzón et al. (2019) PLoS Genetics 15(2):e1007915 :

Mockly et Seitz (2019) Methods in Molecular Biology 1970:291–314 :

Scripts et données pour la préparation de la Table 1

Rodríguez-Martínez et al. (2017) Nature Structural and Molecular Biology 24(3):290–299 :

Scripts et données intermédiaires

Pinzón et al. (2017) Genome Research 27(2):234–245 :

Comparaison de l'amplitude de la répression guidée par miR-223 à la variabilité inter-individu dans l'expression des cibles : code source et fichiers de données.
Quantification absolue des ARNm des cellules C2C12 au cours de la différenciation : code source et fichiers de données.
Comparaison globale de la sensibilité des gènes au dosage et de la conservation des sites d'interaction aux miARN : code source et fichiers de données.

Scripts et données pour la préparation des 6 figures :

Royo et al. (2015) PLoS Genetics 11(10):e1005461 :

Scripts et données pour la génération des figures 2D, 3B et 4A

Conversion des fichiers FCS de cytométrie en fichiers texte :

Script de conversion (usage : ./read_FCS.py input.fcs output.txt) : script python.